急性化脓性胆管炎首先应当选用敏感的抗菌药物联合应用，常采用第三代头孢菌素或碳烯青霉素联合硝咪唑类药物应用。同时注意纠正水、电解质和酸碱紊乱。在非手术治疗的基础上，注意针对病因进行处理。最常见的原因是结石所造成的，还应当根据结石的位置选择不同的处理方式，比如说胆总管切开胆道镜取石或内镜ERCP取石。而如果出现梗阻，还应当首先选择进行胆道减压，如T管引流或者鼻胆管引流，必要时可以考虑同时取出结石。如果是由于胆管癌或者胆道狭窄所造成的，可以考虑先放置支架，减轻炎症症状，再考虑二期手术或者介入治疗。