超声内镜检查有别于一般所认识到的超声检查项目，市级三甲医院一次超声内镜检查约500元左右。超声内镜检查项目类似于胃镜的检查及操作，一般不是由超声影像诊断医生操作，而是由有资质的消化内科医生进行检查，由于涉及超声内镜插管操作，故它的收费是含有超声内镜消毒、被检查者麻醉、插管等一系列操作，并出具超声内镜检查诊断报告。