治疗慢性浅表性胃窦炎，首先应该去除病因。合理饮食，主食多元化，不要吃刺激性较大的食物，不要喝浓茶，戒除烟酒，少吃油炸腌制和熏烤的食物。同时还应该选择抗幽门螺旋杆菌感染的抗生素。可以使用氨苄青霉素配合克拉霉素、替硝唑，坚持用药7～10天，重新进行呼气试验检查。根据具体症状，选择抑制胃酸分泌或者是促进胃肠道蠕动的药物对症治疗。