1、革兰阳性菌败血症：以金葡萄最为常见，表皮葡萄球菌(表葡菌)也不少见，其他还有肺炎球菌及溶血性链球菌，后者常引起新生儿败血症，另外D组链球菌(肠球菌)以易并发心内膜炎。
2、革兰阴性杆菌败血症：患者健康情况一般较差，多数伴有影响机体防御功能的原发病，属于院内感染者较多。致病菌侵入广泛，包括泌尿生殖道、肠道、胆道以及呼吸道，病原菌以大肠埃希菌最为多见，肺炎克雷伯菌有增多趋势，铜绿假单胞菌败血症最为凶险。
3、厌氧菌败血症：入侵途径以胃肠道和女性生殖道为主，其次为褥疮、溃疡等，临床上肝硬化、糖尿病、恶性肿瘤及尿毒症患者易发生厌氧菌败血症。
4、真菌败血症：一般发生在严重原发病的病程后期，多发生在免疫功能低下者，常见于长期接受广谱抗生素类药物、肿瘤化疗、器官移植、严重烧伤等患者。