多囊肾患者晚期肚子大的原因一般是两个，一方面原因是多囊肾本身会长得很大，在腹腔里面占很大的体积，另一方面原因是患者因为腹水而导致肚子很大的情况，具体分析如下：
第一、多囊肾自身因素：多囊肾是遗传性疾病，患者的肾脏会有很多大小不一的囊泡。囊泡会逐渐生长，生长到最后肾脏体积可以长得很大，甚至有的人肾脏可以长到20cm以上，此时就会影响到肚子，从而出现肚子大的情况。
第二、腹水：通常情况下多囊肾晚期时，患者会出现肾功能的严重减退，而导致肾功能不全，甚至尿毒症，从而导致病人肾脏的排水能力弱，此时患者会出现因为排水不好而导致的腹水，腹水也会进一步加重，出现肚子大的情况。