肛周脓肿因为分类不同，治疗手段也有差异。一般来说，肛旁皮内脓肿因为感染比较表浅，单纯的局部换药，抗感染是可以完全治愈的，不需要手术治疗。若是肛旁皮下脓肿，是指在肛门周围皮下缘形成感染，这种情况下患者肛周疼痛剧烈，一旦脓肿有明显的波动感，需要在腰麻下进行脓肿切排引流。而对于坐骨肛管窝脓肿，骨盆直肠窝脓肿，直肠壁内脓肿，这是些脓肿位置较深，会引起严重的全身感染，必须进行手术治疗的。