鞍区脊索瘤晚期治疗主要是以放射治疗为主，因为晚期鞍区脊索瘤可能错过了手术时机，放疗可以考虑单独使用质子束治疗或者与高能量X线联合治疗，有可能会提高患者的生存率。但是，由于技术或者仪器限制很多，可能会使相关治疗难以得到安排。对于鞍区脊索瘤的治疗，最主要就是早期发现病变，如果能够早期发现，为手术提供时间，可以早期通过手术切除，再辅以放射治疗，可以延缓患者的生存率。但是，对于晚期脊索瘤患者，由于错过了手术时机，生存时限不会太长。