脊膜膨出症术后后遗症主要包括：1、脑积水：脑积水首先需要除外分流失败的可能。2、脊髓空洞或延髓空洞。3、脊髓栓系综合征：几乎所有脊髓脊膜膨出修补术后的放射学检查均可发现脊髓栓系，但只有少数出现症状，对症状行脊髓再栓系尚无较好的检查方法。4、枕骨大孔区延髓受压。5、在手术部位出现皮样肿瘤，发病率约为16%。本病的预后如果未进行任何治疗，只有14%-30%的患者可存活过婴儿期。通常只有病情最轻的患者能存活，70%智商正常，50%能够行走。