新生儿脊髓栓系脊膜膨出建议早期进行手术。手术应该在神经症状不太严重时尽早进行，一般建议在出生后1-3个月内进行手术治疗。手术的目的主要是解除脊髓栓系，分离和回纳脊髓和神经根，将膨出的囊予以切除，同时取硬脑膜移植片，将硬脑膜下腔予以关闭。当合并有脂肪瘤、囊肿及其他肿瘤，应该尽量切除，前提是不加重脊髓症状。手术之后需要将患者置于俯卧或者侧卧位，臀部略垫高，切口敷料用小沙袋加压，这样可以促进切口愈合，防止脑脊液漏，手术之后的患者需要定期随访。