对于斜坡脊索瘤后期的患者来说，容易出现反复的头痛，头昏，头痛一般呈后枕部向前额部放射，间断性发作持续性加重，同时由于肿瘤的不断生长，对附近的神经组织造成明显的压迫和侵犯，部分患者可能会有嗅觉丧失。另外有部分患者可能会出现明显的视力下降，或者是视野缺损，以及患者出现面部肌肉麻木。患者往往由于严重的颅神经功能障碍危及生命，甚至死亡。