脑部CT能观察脑内各种结构发生的疾病，还能观察颅骨的疾病。颅内病变包括大小脑及各种实质结构的出血、梗塞、肿瘤等，还有各种腔隙的积水、积液和出血。通过增强CT还能观察肿瘤的血供多少，进一步明确肿瘤性质，增强CT后血管重建（CTA）还能观察血管走行、有无狭窄扩张、有无发育异常等。除了颅内结构，通过调节图像的灰度和对比度，还能观察颅骨的形态和结构，如外伤时，观察颅骨是否有骨折。