肥厚型心肌病具体根据病史及体格检查，超声心动图、cmr等进行鉴别诊断。如与高血压性心脏病、主动脉瓣狭窄、先天性心脏病、运动员心脏肥厚等左心室负荷增加引起的心室肥厚鉴别。还有淀粉样变、糖原贮积症异常物质沉积引起的心肌病。嗜铬细胞瘤、血色病、线粒体肌病、遗传性共济失调等全身性疾病也可能引起心肌肥厚，需要鉴别一下。