功能性尿路梗阻是指整个泌尿系统无器质性病变，也无尿路结石的情况，但就是出现了尿液滞留，不能排出的情况。比如患儿先天性脊髓发育不良导致神经功能异常，膀胱逼尿肌无法正常收缩，使膀胱尿液潴留，这属于膀胱出口障碍引起的尿路梗阻；还有先天性巨输尿管也属于功能性尿路梗阻。在治疗上来说，这一类的尿路梗阻比器质性尿路梗阻复杂困难的多。