结直肠炎的治疗方法最主要是局部灌肠，药物直接作用到肠道，主要用的是中药和西药联合灌肠，中药我们常用一些三黄汤，黄芪、黄柏、黄连，西药主要是甲硝唑，早上灌中药，晚上灌西药。
如果患者结直肠炎比较重，有溃疡、糜烂、出血，可以加口服的美沙拉嗪，也可以同时用美沙拉嗪栓剂睡前塞到肛门里，也可以用美沙拉嗪类灌肠液给患者灌肠。
一个疗程争取坚持10-14天，根据疗效而定，只有这样才是一个治疗的正确方式。