直肠炎的治疗方案其实有很多种，最常见的是局部用药，在直肠肛门口给予直肠灌药，可以中药、西药联合应用，中药最常见的多用红糖，还有成品治疗，比如康复新液，还有中成药治疗直肠炎，西药主要是甲硝唑、奥硝唑兑上氢化钠给予灌肠，这是西药治疗。
其次还有理疗，比如微波、坐浴、热熏这些都可以，这是理疗。口服用药属于全身性用药，口服用药主要看患者的症状，假如患者症状特别重，有出血、便血特重，那样可以用美沙拉嗪，如果特别重的也可以局部灌肠美沙拉嗪或美沙拉嗪栓。