药物治疗主要针对的是病理性飞蚊症，一般以下两大类病理性飞蚊症可通过眼药水或口服药物达到有效治疗效果。第一、炎症性飞蚊症，主要是葡萄膜炎引起的飞蚊症，这种情况可通过滴用激素类和非甾体抗炎类药水控制炎症，临床比较常用的是妥布霉素地塞米松滴眼液和普拉洛芬滴眼液，能使飞蚊症得到很大程度缓解。第二、血性飞蚊症，可通过口服含碘类药物，通过促进代谢，加速飞蚊症的缓解，临床常用的是卵磷脂络合碘片，具体用量应由面诊医师根据病情给出建议。如果是由于机体老化或者高度近视等原因引起的退化性飞蚊症，使用药物治疗通常达不到非常明显的效果，这时应该进行详细的眼底检查，确定飞蚊症的发生原因，并寻找其他有效治疗措施。