虹膜激光打孔的副作用主要有前房积血，眼压增高，损伤晶状体，损伤角膜内皮，虹膜激光打孔通常用于急性闭角型青光眼及临床前期的眼睛，还有就是浅前房的眼睛，为了预防青光眼急性发作则给予虹膜激光打孔，从而解除瞳孔阻滞，保护视神经，然而由于利用了激光的爆破作用，很容易损伤晶状体，虹膜，爆破后的碎屑组织很容易阻塞房角造成眼压升高。