在脑内神经元的胞体聚集的地方，形成的灰质团块，称为神经核，包括基底神经核也叫基底节，包括尾状核、豆状核（包括壳核和苍白球）。脑干内神经元胞体聚集的地方形成的灰质团块称脑神经核，其中包括：动眼神经核，动眼神经副核、滑车神经核、面神经核、三叉神经核、孤束核、前庭神经核、迷走神经背核和孤束核等。脑神经核主要管颜面部器官的感觉、运动及反射，同时还发出神经纤维，参与植物神经的组成支配内脏的活动。