脑干血栓是脑梗中较为严重的一类，属于瘫痪，并发症多，致残率及致死率较高的疾病，一旦发病需尽早就医。一般情况下越早治疗，疗效越显著。1.发病在6小时内可以溶栓治疗。2.抗血小板聚集治疗：发病后尽早给予口服阿司匹林，不耐受阿司匹林的患者可口服氢氯吡格雷。3.神经保护治疗：依达拉奉、胞磷胆碱等药物可保护脑细胞。4.其他：丁基苯酞、人尿激肽原酶、扩容治疗等。5.若血管狭窄或闭塞的患者可行内膜剥脱及支架植入等介入治疗。6.康复治疗：病情稳定后应尽早进行专业的康复治疗以提高生活质量。