扁桃体结石是由于扁桃体陷窝口内有细菌积存，可以产生一些炎性分泌物，有时进食后的食物残渣存留于扁桃体陷窝口，细菌分解食物，其产生的分泌物存留过久，形成结石，储存于扁桃体陷窝口处。有时扁桃体结石可以自行脱落，吐出具有臭味的质硬颗粒。由于结石位于扁桃体陷窝口处，自行取出结石有可能损伤陷窝口，影响陷窝内分泌物排出，导致扁桃体炎。所以不建议自己去除扁桃体结石。