对于慢性胃肠炎的患者，首先在生活习惯上要避免腹部受凉，必要的时候进行腹部保暖，生活中尽量保持情绪的稳定，饮食方面尽量不要吃油炸、辛辣刺激的食物。药物的治疗也很重要，主要是针对一些症状给予处理，有腹泻症状可以吃蒙脱石散止泻，吃益生菌改善菌群失调，并且也可以服用谷物类、参类以及修复肠黏膜的药。
如果有胃上部腹胀，肯定要吃促消化、促动力的药，胃酸分泌过多可以吃奥美拉唑等抑制胃酸的药物。整体来说还是应该从饮食生活习惯的改变上来辅助药物治疗，慢慢的进行恢复。