慢性肾功能衰竭原因很多，基本可以分为肾前性，肾性以及肾后性。肾前性原因有肾前性缺血或者缺水，灌注减少，肾功能受损。肾性原因有小球性，小管性，血管性及其肾间质性。药物，毒物可以造成肾小管损害，系统性疾病，例如系统性红斑狼疮，高血压，糖尿病等，不但造成肾小球损害，也可以造成肾小管和肾间质损害。肾后性的原因主要是梗阻性因素，造成肾脏积水，如果超过4周没有解除，就可以造成慢性肾衰竭。