多发性脑腔隙灶缺血灶一旦发生，主要是由于栓子脱落，而栓塞到颅内小的分支而引起。因为是颅内小的分支动脉供血受到阻塞，临床症状一般不会太重。治疗主要是二级预防及使用改善微循环的药物，比如血栓通、丹红注射液等，以改善缺血症状。其次，在二级预防方面需要积极与规律的监测好血压及控制好血压水平。同时，可以口服阿司匹林或者波立维以控制血小板聚集。如果存在高脂血症，需要口服立普妥降脂治疗。除此之外，需要积极控制血管相关危险疾病，比如糖尿病、心律失常、心脏病等。