头颅磁共振检查主要用于神经内科及神经外科颅脑疾病的检查，一般检查费用跟医院的级别和所在的省份及检查的序列不同收费不同。一般来说，医院级别越低，收费越低。就陕西省的二级医院来说，头颅磁共振的检查费用：头颅磁共振平扫440元（包括T1，T2两个序列），以后在此基础上每增加一个磁共振序列费用增加360元。