色素性毛表皮痣病因尚不明确，因此无有效的预防措施，但本病常在曝晒后发生，且皮损部位暴晒后可出现色沉的加深，故需注意防晒，可能会有一定的帮助。
1、物理防晒：如衣物遮挡、遮阳伞、避免日晒时外出等。
2、化学防晒：如二氧化钛霜、氧化锌霜等，建议以物理防晒为主。