基底节区腔隙性脑梗塞的治疗：
一、针对病因进行预防，比如需要治疗高血压，如果高血压水平控制欠佳，再次复发的可能性就比较高。因此，需要规律服用降压药，并定期监测血压水平。积极治疗心房颤动，因为心房颤动可以导致小的血栓脱落，也很容易导致再次发生基底节区腔隙性脑梗塞。同时，针对相关危险疾病进行积极治疗。
二、需要使用抗血小板聚集药物，因为抗血板聚集药物，目前已广泛应用于缺血性脑卒中的二级预防，基底节区腔隙性脑梗塞也属于脑卒中的一种。
三、在生活中需要保持良好的生活习惯，比如减轻体重、低盐低脂饮食、戒烟酒、避免情绪激动等，均是预防该疾病再次发作的相关方法。