疟疾的传播途径主要是通过按蚊叮咬，极少数通过输血感染。在非洲地区由于经济条件差，气候热，蚊子多，因此非洲地区是发病率高的地区。
在非洲的撒哈拉地区，冈比亚按蚊和不吉按蚊被认为是导致高传染率的主要原因。在南美洲和东南亚没有这些种类的按蚊，传染率相对比较低，所以被蚊子叮咬的次数越多，感染疟疾的概率也就越大。
推荐预防疟疾的方法主要是使用蚊帐，穿长袖衬衣，穿长裤，使用驱赶蚊虫的药物。