1、根据病情和病程，感染性心内膜炎可分为急性和亚急性两种。：
（1）急性感染性心内膜炎：或称急性细菌性心内膜炎，主要是由致病力强的化脓菌（如金黄色葡萄球菌、溶血性链球菌和肺炎球菌等）直接侵袭和破坏瓣膜引起。
（2）亚急性感染性心内膜炎：也称为亚急性细菌性心内膜炎，主要由毒力相对较弱、身体某些部位的常驻菌引起。最常见的是草绿色链球菌，其次是肠球菌、表皮葡萄球菌、立克次体、真菌等也可引起此病。
2、按照感染部位及是否存在心内异物分类，可分为以下几类：：
（1）左心自体瓣膜感染性心内膜炎：左心自体二尖瓣、主动脉瓣感染所致心内膜炎。
（2）左心人工瓣膜心内膜炎：左心二尖瓣、主动脉瓣置换人工噼莫后出现的感染，又可分为早期人工瓣膜心内膜炎（瓣膜置换术后<1年发生）、晚期人工瓣膜心内膜炎（术后>1年发生）。
（3）右心感染性心内膜炎：右心三尖瓣、肺动脉瓣感染导致的心内膜炎。
（4）器械相关性感染性心内膜炎：包括发生在起搏器或除颤器导线上的感染性心内膜炎，可伴或不伴有瓣膜受累。