肛门内部胀痛多为局部感染、化脓或组织间液体渗出滞留所形成。高位肛周脓肿如骨盆直肠间隙、直肠后间隙、黏膜下间隙的脓肿初期以直肠内胀痛为主，同时可伴有高热等全身症状。嵌顿痔或直肠脱垂嵌顿也可出现肛内胀痛，肛门处可见脱出的痔核或直肠。直肠炎症也可以出现肛门坠胀疼痛，可伴有排便次数增多、粘液血便等。中晚期直肠癌也可见肛门内部胀痛，指检时可触及肿块。其它系统如泌尿、生殖系统疾病因炎症刺激亦可导致肛门胀痛。