磁共振目前在临床的应用越来越广泛，颅脑病变、颈髓损伤、椎间盘病变、胸部扫描、腹部扫描，四肢软组织病变的扫描都需要用到磁共振检查。尤其是为了检查软组织的病变，磁共振具有得天独厚的优势。磁共振对软组织的病变非常敏感，这是普通X线和CT都不具备的。磁共振对于身体内含水分子较多的器官有很好的检出效果，比如眼部的病变。