新生儿化脓性脑膜炎的常见病原菌有脑膜炎球菌、肺炎链球菌和乙型流感嗜血杆菌，这三种细菌引起的化脓性脑膜炎占全部患者的80%以上，其他致病菌包括金黄色葡萄球菌、变形链球菌、厌氧菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌和沙门氏菌。
感染途径主要包括血液扩散和直接扩散，通过脑脊液途径直接进入脑脊液，导致脑膜感染。脑膜炎球菌引起的流行性脑膜炎好发于儿童，流感嗜血杆菌引起的脑膜炎多发于六岁以下的小孩，肺炎链球菌引起的脑膜炎多发于老年人，患者表现为发热、头痛、恶心、呕吐和脑膜刺激症状。