更年期女性通过口服、皮肤给药或阴道给药的方式，使用雌激素、孕激素、雌孕激素复方制剂或替勃龙进行治疗。激素的治疗需要适应症，绝经相关的症状明显，如果泌尿、生殖道萎缩，存在相关的问题，反复的泌尿系感染、性交困难、低骨量或骨质疏松症的病人可以在医生指导下选择激素的治疗。
有些情况不能使用，像已知或怀疑妊娠，原因不明的阴道出血，已知或怀疑有乳腺癌，有雌激素依赖的肿瘤、子宫内膜癌，同时在半年之内有活动性的静脉、动脉血栓疾病，严重的肝肾损伤、脑膜瘤的病人不能使用，血卟啉病人也不能使用。如果有子宫肌瘤、子宫内膜异位症的患者，也应该非常地慎用。
常用的药物有雌激素、孕激素、雌孕激素的复方制剂，可以采用单纯雌激素或单纯孕激素、雌孕激素联合的方案，既可以周期的序贯疗法，也可以连续的序贯治疗，联合连续疗法，都是选择的治疗方式。但是在治疗期间要注意，如果出现了子宫出血，要及时停药。
同时要警惕雌激素的副作用，雌激素剂量过大会引起乳房胀痛、白带增多、头痛、水肿、色素的沉着，同时口服雌激素还有增加胆囊结石、血栓的风险。孕激素主要和情绪变化密切相关，过量服用可能出现的副作用有抑郁、容易发怒、乳房胀痛和水肿，应该在医生的指导下定期评估更年期使用激素的疗效和安全性。