耐药菌会很少传染给健康人。但是，当机体免疫力低下、正常菌群失调的病人，接触到耐药菌时会发生感染，感染部位通常为血液、尿道、肺部和伤口等。耐药菌感染多为接触传播，通过医护人员或陪护的手以及卫生医疗用品等传播治病菌，耐药菌的产生多为长期不规律使用抗生素引起的细菌耐药，当机体发生感染时就会造成耐药菌定植，如果临床耐三类或三类以上就属于多重耐药菌感染。