最常见的导致半夜胃痛的原因包括胃炎、胃溃疡和消化道穿孔。早期急性阑尾炎可出现胃痛，伴恶心、呕吐，随后出现右下腹痛转移性疼痛，胃痛及进行性加重的患者，应该及时到医院就诊，完善腹部平片及腹部CT检查，病情稳定时建议加强胃镜检查。
睡觉半夜胃痛有可能是胃十二指肠溃疡引起，尤其是十二指肠溃疡，疼痛多在夜间发作，称为饥饿痛，半数患者有半夜疼痛，患者常惊醒。疼痛可能持续数周或者几个月，也可能会出现反复。上述症状可能与胃酸分泌异常、幽门螺杆菌感染和不规则的饮食、工作、生活压力和精神因素密切相关。