阴茎上方的皮肤囊肿，可以有以下几种方法进行处理：一、观察处理：小的囊肿，如果没有形成感染，不影响性生活，可以不予处理。二、手术处理：1、小的囊肿，如果在3mm以下，可以使用电刀或激光直接进行烧灼，创面不需要进行缝合，自己能够长好。2、大于3mm以上的囊肿，如果进行烧灼以后，创面不容易愈合，所以建议通过手术切除，创面需要进行缝合处理。