药物治疗，虽然效果非常有限，但可以使自闭症的症状得以改善，比如第一代抗精神病药氟哌啶醇、硫利达嗪等可减轻患儿多动、冲动、自语、自伤和刻板行为，稳定患儿的情绪，舒必利可改善患儿孤僻、退缩症状。第二代抗精神病药，利培酮、阿立哌唑可有效改善患儿的多动、坐立不安、情绪不稳、易激惹、发脾气、重复行为、攻击或自伤行为，同时对患儿的社交行为可能也有一定的改善作用。抗抑郁药，五羟色胺再摄取抑制剂使用最多，比如舍曲林、氟伏沙明等可改善自闭症患儿的焦虑、抑郁、强迫和刻板重复行为。非中枢兴奋药，托莫西汀、可乐定可改善患儿伴有的注意障碍及过度活动；教育训练，是自闭症治疗中非常重要的方法，比如结构化教学、图片交流系统、地板时光等对改善患儿在交往、交流、认知、生活自理等方面有很大的改善作用；另外，行为矫正治疗可使患儿建立新的良好行为，改善患儿的异常行为。