通水手术不会有后遗症。通水指的是子宫输卵管通液术。子宫输卵管通液术是女性不孕患者的一项基本的检查，它主要是用来检查输卵管是不是通畅，是用一根细管插入宫腔，通过观察注水是否通畅，来判断输卵管是否通畅，一般情况下会有轻微的腹痛，没有后遗症。但是如果操作不当，比如说无菌观念不强，会引起感染，导致宫腔粘连，加重不孕。