丙肝的治疗分两方面：保肝治疗和抗病毒治疗。保肝治疗和其他肝功能损害所使用的保肝药物没有多大的区别。与其他肝病不同的，是丙肝的抗病毒治疗。目前，抗病毒治疗分为两种方法，一种方法是注射长效干扰素加口服利巴韦林，这种方法由于副作用大、治愈率不高，已逐渐很少使用。另一种方法，是口服小分子抗病毒药物，主要是以索磷布韦为核心的直接抗病毒药，如吉二代和吉三代等，总体的治愈率高达95%以上。