如果输尿管结石比较小，比如＜6mm的结石，可以进行药物治疗，可以使用双氯芬酸钠栓剂，也可以口服α受体阻滞剂和钙离子通道拮抗剂，还可以服用一些中药，比如尿石通、排石颗粒。另外，对于某些纯尿酸结石或者胱氨酸结石，可以通过药物溶石，比如简化尿液，服用枸橼酸盐和别嘌醇等。