慢性化脓性中耳炎治疗原则为控制感染、通畅引流、清除病灶、恢复听力、消除病因、避免听力受损。
一、药物治疗
1、抗生素水溶液或抗生素与类固醇激素类药物混合液，如0.25%氯霉素液、氯霉素可的松液、氧氟沙星滴耳液，用于鼓室黏膜充血、水肿，有脓液或黏脓时。
2、酒精或甘油制剂，如4%硼酸酒精、4%硼酸甘油，2.5~5%氯霉素甘油等，适用于黏膜炎症逐渐消退，脓液极少，中耳黏膜水肿、潮湿者。
二、手术治疗
1、乳突根治术：经典的乳突根治手术使外耳道、鼓室、鼓窦和乳突腔形成一个大的术腔，清除被破坏的听骨，以彻底清除病变。该术式可使听力遭到严重损害，故目前仅适用于骨质破坏范围较大的胆脂瘤型中耳炎、合并感音神经性聋或某些颅内、外并发症者，以及咽鼓管功能无法恢复者。近年来，随着耳显微外科、内镜中耳手术以及微创耳外科的开展与普及，及时处理中耳细微病变，彻底清除中耳病灶的同时，保留或改善听觉功能，将会逐步成为慢性化脓性中耳炎手术治疗的基本原则。
2、鼓室探查+鼓室成形术：即包括鼓膜修补、以及听骨链探查听骨链重建。手术目的是清除病灶不再流脓；改善听力，必要时听骨链探查听力重建提高听力；提高生活质量，减轻感冒后或耳内进水后中耳反复感染的困扰，可正常洗澡或游泳。
3、良乳突根治术、完壁式乳突根治：目的是根除乳突、鼓窦和鼓室内病变，鼓膜穿孔将三者与外耳道相通，形成一复盖上皮的空腔。手术目的是彻底清除乳突、鼓窦、鼓室和咽鼓管鼓口病变组织，停止流脓、获得干耳，防治颅内外并发症。
4、单纯乳突切除术：主要是通过磨开鼓窦及乳突，清除其内部的全部病变组织及气房，从而充分引流中耳病变。