1、体格检查：主要检查患儿口腔黏膜的溃烂状况，假膜的颜色，可初步判断是何种细菌感染，对于检查和用药有指导性意义。如为生理性白斑则可排除本病诊断，如为溃烂加之假膜形成，则对本病的诊断有重要的参考意义。
2、血常规：这是常用的血液检查，主要观察白细胞、中性粒细胞以及嗜酸性粒细胞的数值，如果明显超过正常范围，可诊断发生感染和过敏现象。
3、C反应蛋白：需要抽取患者血液进行机器检验，也是常用的细菌感染性指标，如升高则表示存在明显的感染。
4、涂片检查：对于糜烂的口腔黏膜或局部的假膜采取标本进行检查，镜下可见明确的致病菌，对于本病的诊断有重要意义。
5、细菌培养：取口腔黏膜或局部的假膜进行细菌培养，可培养出致病菌即可明确诊断本病，是小儿细菌感染性口炎诊断的金标准。
6、组织病理检查：与涂片检查和细菌培养同理，取口腔黏膜中的病灶进行病理学检查，可见炎性病变，提示为小儿细菌感染性口炎。