黄热病的症状主要包括全身感染中毒症状和受损脏器的相应表现。大多数病人症状较轻，约15%的病人表现为重型。
一、典型症状
黄热病潜伏期通常为3～6天，也可长达10天。大多数症状轻微。典型病例临床过程可分为4期，分别有不同表现。
1、感染期症状：此期为病毒血症期，持续3～5天，表现为寒战、发热、头痛、头晕、畏光、腰骶部和下肢疼痛、肌痛、厌食、恶心、呕吐、烦躁、易怒、全身不适等，但症状无特异性。体格检查可有相对缓脉，皮肤、结膜和牙龈充血，特征性舌苔改变，肝大和上腹压痛。
2、缓解期症状：发热3～5天后，患者进入缓解期，此期症状较感染期有所减轻。
3、中毒期症状：此期特点是病情再次加重，出现多器官功能损伤表现，常累及肝脏、肾脏和血液系统等。
4、恢复期症状：可持续2～4周，症状逐步消失，器官功能也会逐步恢复正常，但乏力可持续数周。黄疸和转氨酶升高可持续数月。
二、伴随症状
中毒期可累及肝脏、肾脏甚至心脏及神经系统。：1、临床表现为体温再次升高，黄疸逐渐加重，频繁呕吐，上腹痛。还可以出现多部位出血，如皮肤瘀点、瘀斑、鼻出血、牙龈出血、黏膜出血，甚至腔道大出血、休克。
2、肾功能异常可有蛋白尿、血尿，尿量减少，甚至无尿。
3、心脏表现可有心电图ST-T改变，心脏扩大。
4、神经系统表现为躁动、谵妄、昏迷等。