左旋肉碱禁忌症是患有各种基础疾病的患者，常见有心脑血管病变、动脉粥样硬化、肝肾疾病患者，另外过敏体质患者也不建议服用，因其可能会对其中的某些成分过敏，产生明显严重的过敏反应，甚至出现过敏性休克。有胃肠道疾病患者也不能服用左旋肉碱，因为药物可能导致患者出现严重的胃肠道反应。另外长期服用、夜间服用等都是不合适的。