二期膜性肾病治愈率约70%，膜性肾病部分患者可自行缓解，30%-40%患者经过治疗可治愈，但有复发的可能，10%-20%患者肾脏疾病逐渐加重，出现肾功能衰竭。
膜性肾病病理分期分五期，临床治疗除考虑病理分期外，还需要结合膜性肾病的危险程度分级。低危患者的尿蛋白定量<4g/d，可给予对症治疗，给予降蛋白尿药物，如ACEI和ARB类，联合黄葵胶囊等治疗。
中危患者对症治疗半年，尿蛋白仍然没有缓解，以及高危患者尿蛋白定量>8g/d，均需要免疫抑制治疗，免疫治疗常用药物有激素联合免疫抑制剂。