在强直性脊柱炎的病人中，约90%的患者HLA-B27是阳性的，普通人群中HLA-B27的阳性率大约在10%左右，所以强直性脊柱炎与HLA-B27有高度的相关性。目前发现有210种以上的HLA-B27亚型，其中B2704、B2705最为常见，强直性脊柱炎的发生除了与HLA-B27阳性有关之外，还受其他因素的影响，比如肠道菌菌感染等等。