食管癌的病因并不是非常的明确，但可能与以下的因素相关：
一、饮食与不良的习惯，如果进食过快、过烫，并且喜欢进食粗硬的食物，咀嚼槟榔都与食管癌有关，吸烟的患者食管癌的发生率也是明显增高的，那饮酒的患者可以增高到7甚至50倍。
二、亚硝酸类化合物的摄入，在食管癌的高发地区，发现亚硝酸胺的含量是明显增加的，所以建议低盐饮食，并且不进食过夜的食品，从而减少亚硝酸胺类化学物的摄入。
三、霉变及其毒素对食管癌的发生也是有作用的，所以一定要进食新鲜的水果、蔬菜，避免食用霉变的食物。
四、慢性的刺激，比如反流性食管炎长期不见好，有可能会诱导巴雷特食管的发生，从而进展为食管癌。
五、癌基因，也就是食管癌有遗传倾向，存在这种癌基因的人，可能他的发生率就比普通人要高。