1、体格检查：阑尾黏液囊肿患者多无明显体征，常表现为无症状的右下腹包块，且需注意腹壁肌肉的紧张程度，有无压痛及压痛的范围情况等。
腹部超声检查：B超对诊断>15mm的阑尾黏液囊肿敏感性为83％，特异性为92％。阑尾黏液囊肿在B超下的特点为探及右下腹阑尾区存在异常肿物，肿物呈圆形、椭圆形或分叶状。外壁光滑，边界清晰，与周围组织无粘连，囊壁不厚，失去正常的阑尾壁结构。肿物为囊性或囊实性，内透声差，可见絮状弱回声漂浮，实质部分可见少许血流信号。
2、腹部CT检查：CT可以显示阑尾黏液囊肿的病灶特点，了解与周围组织及脏器的关系，在临床诊断中有着重要作用。阑尾黏液囊肿的主要CT表现为右侧髂窝区与回盲部关系密切的圆形或椭圆形囊性病灶，囊壁较薄，光滑，并可伴有钙化，边界清晰，内容物为均匀一致液性密度。增强扫描囊壁可有不同程度强化，囊腔内无强化，病灶近盲肠段可见阑尾管壁增厚、强化。
3、腹部MRI检查：MRI具有多种序列及扫描方式，组织分辨率高，对阑尾黏液囊肿的囊壁、囊液均匀分辨更加清晰，对囊壁的完整性及边界判断更准确。阑尾囊液囊肿的典型MRI表现为病变位于右下腹，边界清晰，与盲肠关系密切，盲肠呈外压改变；呈均匀长T1、长T2信号。囊壁较薄、均匀，信号与肠管壁相似，肿物横断面呈类圆形或椭圆形，矢状面或冠状面呈长管状或“葫芦状”。
4、肠镜：阑尾黏液囊肿在肠镜检查中的显著特征为阑尾开口部腔内突出性肿物及阑尾开口移位和闭塞。一般表现为阑尾开口隆起型病变，表面黏膜良好，部分呈囊样表现，阑尾腔内隆起恒定存在，与充气状态及收缩状态无关系。
5、超声内镜：阑尾黏液囊肿超声内镜的主要表现为有着显著的壁结构，囊壁较厚，囊壁结构完整，与周边组织间隙清晰。
6、钡剂灌肠：钡灌肠造影对阑尾黏液囊肿的临床诊断有较大价值。其X线表现有阑尾不充盈，回盲部黏膜光滑，且完整、无破坏。结肠外界线尖锐的肿物，压迫盲肠产生弧形压迹，部分囊壁有钙化。
7、肿瘤标志物检查：主要是用于黏液性腺癌的筛查，判断疾病的良恶性程度。