沙眼衣原体检测阳性代表人体感染该病原体，常见于眼部疾病、泌尿生殖道疾病、呼吸道疾病，具体如下：
1、眼部疾病：如沙眼、包涵体性结膜炎、新生儿眼炎等。沙眼是指沙眼衣原体感染眼结膜上皮细胞后，在其中繁殖并形成包涵体，引起局部的炎症，导致患者流泪、眼睑内翻、倒睫，甚至损害视力。
2、泌尿生殖道疾病：如衣原体性尿道炎/宫颈炎、输卵管炎、直肠炎以及性病淋巴肉芽肿等。这类疾病经性接触传播，男性多表现为非淋菌性尿道炎，合并直肠炎、前列腺炎，女性多表现为尿道炎、宫颈炎、输卵管炎与盆腔炎等，可引起不孕或宫外孕等严重并发症。
3、呼吸道疾病：如婴幼儿肺炎，新生儿经母亲产道分娩时，可感染沙眼衣原体，引起肺炎。