藿香正气水的主要成分为：陈皮、白芷、茯苓、半夏、紫草油、仓术为主，配以酒精所以喝完藿香正气水时，首先反应是药物有辛苦的味道。当药物通过食道进入胃内后，会有轻度的反酸烧心。胃肠道功能不和者或有急性胃肠炎者，还会引发腹部腹不适及恶心、呕吐、腹胀的症状。如在喝藿香正气水之前之后饮酒者，会引发双硫仑样反应。轻则自行消退，重则会出现皮肤过敏及呼吸困难、心悸等反应，如出现上述反应，严重者需立即就医。