黑枸杞和红枸杞同属于茄科枸杞，两者最大的区别不仅在于颜色，各自的功效也有很大不同。
从外观看，黑枸杞是野生的、颗粒小、带果柄、含糖量小，直接嚼食只有稍微的甜味，红枸杞是扁长形的红色果实，没有果柄、含糖量大，直接嚼食口感甘甜。从营养成分看，黑枸杞游离氨基酸的含量超过红枸杞，微量元素中的铁、钙、镁、锌、铜等含量也远高于红枸杞的平均含量。
从功效来看，黑枸杞和红枸杞都具有补肝肾、益精血、明目的功效，但是黑枸杞中含有红枸杞所没有的花青素，其抗氧化、抗衰老作用优于红枸杞。